1998年8月，为串连树灵塔一带的红桧巨木，林务局在光武桧及千岁桧架设木栅围栏，并兴筑观景台，连同第一期的巨木群栈道，便形成游乐区内颇具规模的巨木群系统。2001年起，位于阿里山吊桥另一端的香林国小后方，林务局针对原始桧木林再开辟第二期巨木群栈道，全长450公尺，沿线有21棵红桧巨木错落其间，其中又以香林神木胸围14.3公尺，独霸游乐区内的巨木群。栈道终点则兴建拱桥一座，名曰“神怡桥”，与神木遗址的阿里山森林铁路相会合。每年三月中旬起，巨木群栈道沿途森氏杜鹃盛开，花团锦簇的杜鹃花丛妆点高耸入云的桧木林，时而云雾飘渺，便形成独特的阿里山花季景观。

巨木群栈道穿梭在古木参天的林荫道上，将各高耸入云霄的神木们做连结，让游客可以漫步在这片巨木群里，沿着步道，可欣赏到三、四十余棵的巨木。步道从香林国中旁连接光武桧、千岁桧、博爱亭至神木颂亭、一直连接到香林国小后方， 全长约 1100公尺 ，整条步道大都以防腐木材用栈道架空方式，搭建穿梭在茂密的森林中，远远一望，有如巨龙盘踞，尽职的守护着这生机盎然的千年红桧巨木林。游客徜徉在这片森林里，浓郁的芬多精，无不让人神清气爽；画眉、山雀的优美歌声，再加上洒落在这片林荫的点点阳光，走上一回，就好像做了一次天然的SPA。

森林游乐区内的变色叶植物以台湾红榨槭最为艳丽，每年11月到隔年3月是他的变叶与落叶期；而其他优美的观赏树种还有阿里山榆、云叶、玉山假沙梨等树木。森林游乐区内的台湾原生观赏花木众多，以台湾一叶兰、玉山杜鹃、阿里山十大功劳、台湾马醉木、梅花和各种樱花最具特色。此外，有栽植一些非本土的观赏性植物，如雏菊、蓬蒿菊、大波斯菊、毛地黄、木兰、洋玉兰、萱草、吉野樱、千岛樱、大岛樱、八重樱、绣球花、射干菖蒲等，而这些非本土的植物，多少也造成了生态环境的影响。

具代表性的哺乳类有台湾黑熊、台湾狝猴、台湾野猪、白鼻心、赤腹松鼠、条纹松鼠、山羌、水鹿等；其中，台湾黑熊、台湾狝猴、山羌、水鹿、白鼻心、台湾狝猴等属于保育类动物，而台湾黑熊、台湾野猪、白鼻心、条纹松鼠、山羌、水鹿是台湾特有亚种，台湾狝猴是台湾特有种。

具代表性的鸟类有帝稚、蓝腹鹇、薮鸟、金翼白眉、白耳画眉、青背山雀、火冠戴菊鸟、栗背林鸲（阿里山鸲）、纹翼画眉、冠羽画眉等；其中，金翼白眉、白耳画眉、薮鸟、纹翼画眉、冠羽画眉等，都是属于台湾特有种。

具代表性的两栖类有台湾山椒鱼、褐树蛙、梭德氏赤蛙、斯文豪氏蛙等；其中，台湾山椒鱼主要生活在高海拔的针叶林下底层岩石或溪流旁，是冰河时期的孑遗物种，属于台湾特有种之保育类动物，数量上非常少。此外，褐树蛙也是台湾的保育类动物。具代表性的.爬虫类有阿里山龟壳花、赤尾青竹丝、斯文豪氏攀木蜥蜴等；其中，阿里山龟壳花属于台湾特有亚种的保育类动物，分布广但数量不多。